Reaktionen blir okontrollerbar
När testet började stängdes generatorerna av och mindre vatten pumpades in i reaktorn. Då mindre vatten fanns i trycktuberna, bildades det hålrum av ånga på grund av den höga temperaturen. Precis som kontrollstavarna absorberar även vatten till viss del neutroner, ånga absorberar dock inte ånga alls beroende på sin låga densitet. När hålrummen av ånga ökade och allt mindre vatten nådde reaktorn, ökade effekten i reaktorn. Detta startade i sin tur en negativ spiral; när värmen ökade avdunstade vattnet och mer ånga uppstod, till över 100 gånger över det normala. Misstaget uppmärksammades snabbt av personalen som slog på säkerhetssystemet. En mängd kontrollstavarna sänktes ner i reaktorn för att minska reaktionerna. Ironiskt nog var det här anledningen till härdsmältan. Ingen i kontrollrummet den kvällen hade kunnat förutse det som sedan skedde.
Felkonstruerade kontrollstavar
Den yttersta delen av kontrollstavarna bestod av grafit. Grafit fungerar som en moderator men kan inte absorbera neutroner. Rören som kontrollstavarna skulle sänkas ner i var fyllda med vatten, vatten som absorberar neutroner och därmed begränsar reaktionshastigheten. Men när kontrollstavarna sänktes trycktes vattnet undan och reaktionen accelererade innan kontrollstavarna hade hunnit verka. Effekten blev att innan borkarbiden som skulle stoppa katastrofen, hann sänkas ner, hann grafiten accelerera reaktionen tillräckligt för att hela kärnan av reaktorn skulle smälta. Till slut byggdes ett sådant tryck upp att reaktorns 1000 ton tunga lock sprängdes av. En andra explosion skedde endast några sekunder senare. Denna explosion resulterade i att brinnande bränsle och grafit kastades ut och syre kom in i reaktorkärnan vilket ledde till att grafiten i moderatorerna började brinna. Brinnande grafit är extremt varmt och var därför väldigt svårsläckt, vilket ledde till den långvariga branden. Eftersom det 1000 ton tunga taket exploderat var reaktorkärnan efter explosionen helt öppen. Rök bestående av radioaktiva isotoper och farliga gaser kunde stiga till en höjd av 1,5 km upp i luften.